Это старый вопрос, я знаю, но, возможно, это поможет кому-то еще.
Используйте этот фрагмент внутри метода, вызываемого для отображения окна файла:
dialog = QtGui.QFileDialog(self)
dialog.setFileMode(QtGui.QFileDialog.Directory)
dialog.setOption(QtGui.QFileDialog.ShowDirsOnly, True)
if dialog.exec_():
for d in dialog.selectedFiles():
print d