Если ваш репозиторий выглядит так:
svn://svn-server/repo/trunk/project-one/
svn://svn-server/repo/trunk/project-two/
svn://svn-server/repo/trunk/very-big-project/
svn://svn-server/repo/branches/project-one/
svn://svn-server/repo/tags/
(etc.)
Затем настройте Hudson так:
URL репозитория: svn://svn-server/repo/trunk/very-big-project
Если проекты независимыи не нужно разветвляться и помечаться вместе), возможно, имеет смысл иметь отдельные стволы для каждого проекта:
svn://svn-server/repo/project-one/trunk/
svn://svn-server/repo/project-one/branches/
svn://svn-server/repo/project-one/tags/
svn://svn-server/repo/project-two/trunk/
svn://svn-server/repo/project-two/branches/
(etc.)
Тогда Хадсон будет
URL хранилища: svn://svn-server/repo/very-big-project/trunk