Я не понимаю, почему iframe? ...
Вы можете делать то, что хотите, на стороне клиента (ajax) или на стороне сервера (php или аналогичный)
С php, например:
В вашем коде xhtml:
<style type="text/css">
...
top: <?php echo $_GET['valueTop']; ?>px;
left: <?php echo $_GET['valueLeft']; ?>px;
...
</style>
Или вы можете написать все свои CSS с серверной стороны ...
С клиентской стороны, например, с помощью jquery (javascript)
$('yourelementyouwantposition').css('top','whatyouwant').css('left','whatyouwant');
И вы можете передать "whatyouwant" со стороны сервера ...