Если вы пишете на диск, пользователь может найти и прочитать ваш файл. Обойти это невозможно, можно отслеживать, что происходит при запуске приложения, находить файлы, в которые оно записывает, или просто перехватывать во время записи. Подумайте, почему вы не хотите, чтобы пользователь находил ваши файлы.
Это потому, что есть конфиденциальные данные или вещи, которые вы бы предпочли, чтобы они не изменились? Попробуйте зашифровать его или проверить его целостность с помощью контрольной суммы или хэша.