Чтобы установить файл apk, вам нужно выполнить
adb install /path/to/file.apk
Пока дроид подключен. Я бы не стал использовать какие-либо программы, кроме ADB, для установки вашего приложения. adb определенно будет следовать правилам, и вы сможете убирать вещи и т. д., если что-то пойдет не так. Это может быть не так с другими программами.
Должен заметить, это предполагает, что вы пишете программу самостоятельно. adb - это программа, поставляемая с комплектом разработки для Android (я предположил, что вы используете ее, поскольку это сайт, связанный с программированием. Если вы не имеете в виду это и просто пытаетесь установить программу на свой телефон, этот вопрос, вероятно, будь лучше на superuser.com)
Редактировать Чтобы ответить на ваш комментарий. Когда вы выбираете «запустить» из eclipse, и ваш дроид подключен, он должен дать вам возможность выбрать, на каком устройстве вы хотите выполнить код. Двойной щелчок на вашем дроиде автоматически установит и запустит приложение. Возможно, вам понадобится включить параметры разработки в меню «Настройки», чтобы они были распознаны. Чтобы подтвердить, что eclipse (на самом деле это adb) может видеть вашего дроида, запустите терминал или командную строку и введите adb устройства, пока дроид подключен. Если он там указан, вам пора.