Не уверен, что я правильно понял, но VS2010 больше не поддерживает Wix?
Может кто-нибудь это подтвердить?
Microsoft рассматривает возможность добавления встроенной поддержки WiX к VS2010, но они передумали.
Ничего не изменилось с более ранних версий Visual Studio.
Прямо от Роба Меншинга: Visual Studio не будет поставлять набор инструментов Wix