Попробуйте использовать тег <asp:ScriptManagerProxy>
. У него те же дочерние теги, что и у менеджера скриптов, но он предназначен для использования в форме контента. (Вы не получите сообщение об ошибке «Только один ScriptManager на страницу»)
Я не уверен, что это именно то, что вы ищете, потому что скрипт, который вы добавляете через ScriptManagerProxy, доступен только в ContentForm, в который вы добавляете его (я думаю). Это не будет сайт широкий. Однако, если вам нужно, чтобы он был доступен для всего сайта, почему бы просто не добавить его в MasterPage?
Надеюсь, это поможет!