Если вы запускаете определенную конфигурацию запуска, проверьте консоль вывода (Ctrl + 0)
Например, он показывает что-то вроде:
"C:\Program Files\Java\jdk1.5.0_22\bin\java" -Didea.launcher.port=7532 "-Didea.launcher...
Process finished with exit code 0
Первая строка - это команда для сборки и запуска модуля ...