У нас та же проблема, когда мы используем svn update. Это происходит с Hudson, а также с разработчиками, использующими Eclipse Ide. Наш обходной путь - удалить локальный проект и снова оформить весь проект. Просто убедитесь, что не , чтобы использовать опцию «использовать обновление» в Hudson.
Часы не должны быть проблемой, поскольку Hudson и Subversion (на самом деле visualsvn) работают на одном сервере.