Вы можете использовать ildasm для преобразования сборки в IL, изменить там значение атрибута и использовать ilasm для воссоздания сборки. Это может или не может рассматриваться как восстановление.
Однако, вероятно, так же просто и быстро условно скомпилировать содержимое атрибутов Assembly в вашем проекте на основе вершины сборки. Разработчики, скорее всего, будут лучше знакомы с этим методом, и, имхо, его легче поддерживать.