У меня была проблема с этим, и я не нашел хорошего ответа. Это был лучший результат поиска, поэтому я опущу некоторую информацию здесь.
Я настроил FlashDevelop 4.0.4 для работы, имел подходящий Flex SDK, имел отладчики. проверил все настройки, удалил, переустановил, перезагрузил и почти все остальное, что ты мог себе представить.
Я обнаружил, что класс точки входа моего приложения фактически не назывался Main. Оказывается, это приводило к тому, что мои трассировки казались ошибочными, так как класс документа не будет печатать трассы, если он не называется Main.