Вы не сможете выполнять свою автономную обработку так, как вы предполагаете. Существует ограничение на количество памяти, которое может использовать ваше приложение, но это не главная проблема. Вся обработка в движке приложения выполняется в обработчиках запросов. Другими словами, любое действие, которое вы хотите, чтобы ваше приложение выполняло, будет написано так, как будто оно обрабатывает веб-запрос. Каждый из этих обработчиков ограничен 30 секундами времени работы. Если ваш процесс будет работать дольше, он будет остановлен. Движок приложения оптимизирован для обслуживания веб-запросов, а не для сложных вычислений.
Несмотря на это, вы можете разбить свои вычислительные задачи на 30-секундные порции и сохранить промежуточные результаты в хранилище данных или в кэше памяти. В этом случае вы можете использовать задание cron или очередь задач (обе описанные в документации механизма приложений), чтобы продолжать вызывать обработчики обработки до тех пор, пока не будет завершен перебор данных.
В целом, да, возможно, можно делать то, что вы хотите, но это может не стоить хлопот. Посмотрите на другие облачные решения, такие как Amazon EC2 или Hadoop, если вы хотите выполнять вычислительно сложные задачи.