Как я могу копировать файлы в Java, используя JNI в OS X?
Вы не должны использовать JNI для копирования файлов. Если вам нужна производительность при копировании большого количества файлов, вам следует взглянуть на новые файловые каналы Java NIO.
Вам не нужен JNI для копирования файлов. Стандартные библиотеки J2SE справятся с этим. Для более мощной библиотеки см. Apache Commons IO FileUtils .