Я не уверен, что понимаю, о чем вы спрашиваете, но я постараюсь ..: -)
applicationDidFinishLaunching является частью протокола UIApplicationDelegate. Как правило, только один класс будет реализовывать этот протокол в одном приложении.
В других ваших классах вы реализуете метод init, если вам нужно что-то делать при создании экземпляра этого класса, например создавать экземпляры и инициализировать значения свойств для этого экземпляра.