Проще говоря, вам нужен фильтр перед JSP. Что-то для последующей обработки результатов.
Фильтр просматривает HTTP-запрос для соответствующего параметра и оттуда решает, фильтровать ли исходящие результаты HTML пользователю.
Что касается фильтрации, вы можете использовать для этого простой REGEX. Недостатки REGEX в том, что вам нужно будет продублировать весь исходящий результат в памяти перед отправкой его пользователю. Это занимает не только память, но и время, в зависимости от того, как ваши результаты отображаются. Но теоретически REGEX может работать.
Лучше было бы использовать потоковый HTML-лексер, чтобы читать содержимое по кусочкам и таким образом фильтровать комментарии. Я не могу предложить что-либо использовать, я написал свой.
Но фильтр - это то, что вы хотите.