Как запустить проект с аргументами командной строки (переключателями) после сборки в Monodevelop?
Перейти к проекту -> Параметры -> Общие -> Пользовательские команды, как здесь
Запустите проект с помощью параметра меню «Выполнить -> Выполнить с -> Пользовательские параметры» или задайте аргументы в параметрах проекта (раздел «Выполнить»).