git отслеживает содержимое, а не файлы. если два файла одинаковы (или почти одинаковы), git распознает их как скопированные. не должно быть никаких последствий от этого
в вашем случае оба файла были идентичны (100%), поэтому у git нет возможности узнать, был ли файл скопирован или просто случайно оказался тем же.
не волнуйтесь, git хранит только снимки дерева в хранилище. вы можете управлять обнаружением копирования и переименования для git log
с параметрами -C
и -M
, git будет стараться найти переименования / копии