Большинство баз данных имеют встроенные опции для регистрации запросов и медленных запросов, поэтому вам не нужно регистрироваться через PHP. Вы не должны регистрировать все запросы в рабочей среде, если у вас нет проблем, и это не является частью процесса устранения неполадок. Вы можете и должны регистрировать медленные запросы, чтобы видеть, что может замедлять работу вашего рабочего сайта.
Если ваша платформа поддерживает это, вы можете регистрировать запросы только в том случае, если для генерации страницы потребовалось определенное время (это то, что я делаю). Затем вы входите в систему условно и можете обнаружить чрезмерное количество выполняемых запросов.