Есть несколько вариантов:
$("div.container div.item").eq(2).after($('your html'));
$("div.container div.item:nth-child(3)").after($('your html'));
$($("div.container div.item")[2]).after($('your html'));
Те же параметры, но вставка в ту же позицию с использованием «до»:
$("div.container div.item").eq(3).before($('your html'));
$("div.container div.item:nth-child(4)").before($('your html'));
$($("div.container div.item")[3]).before($('your html'));