Вы можете создать контроллер while для третьей группы потоков и сделать что-то вроде этого:
ThreadGroup 1
- Код для заполнения таблицы 1
- Установить пользовательскую переменную "Group1_done == true" в качестве последнего шага
ThreadGroup 2
- Код для заполнения таблицы 2
- Установите пользовательскую переменную "Group2_done == true" в качестве последнего шага
ThreadGroup 3
- Когда контроллер "Group1_done == true" && "Group2_done == true"
- Код для заполнения таблицы 3