Я хотел бы использовать файл XML (шифровать, если вы считаете это необходимым) и использовать
Environment.GetFolderPath(Environment.SpecialFolder.ApplicationData)
для сохранения в разделе %AppData%
файловой системы пользователя.
Кроме того, вы можете написать класс «Настройки», который вы сериализуете на диск и десериализуете в память - это может сэкономить вам некоторую логику персистентности с пространством имен XML.