Есть несколько способов сделать встроенные функции gcc. Одним из них является параметр -finline-functions, который сделает встроенные функции gcc «простыми». Компилятор использует некоторую эвристику, чтобы определить, достаточно ли малая функция для встраивания. Однако пользователь имеет некоторый контроль над этим алгоритмом через -finline-limit. Прочтите руководство по gcc, чтобы найти нужные значения.
При встраивании функций вы должны помнить, что, очевидно, не все функции могут быть встроены (самый простой пример - рекурсивные функции), и компилятор может включать только функции, определенные в одном и том же модуле перевода. Кроме того, стоит отметить, что -finline-functions по умолчанию включено в -O3, так что просто -O3 может иногда быть вашим решением.
В make-файле вам нужно будет добавить правильные параметры для всех вызовов gcc. В хорошо написанном make-файле вы легко найдете переменные с другими опциями gcc, где вы можете просто разместить свой собственный.