Исправления безопасности Sql (а также пакеты обновления) обычно загружаются из Microsoft в виде файлов EXE (обычно 3 варианта для x86, x64 или IA64)
Чтобы применить эти исправления, просто запустите файл EXE непосредственно на сервере.
Примечание: ответ может быть немного другим для бесплатных версий SQL Server 2000 (например, MSDE, Sql Express)