Дэвид прав, что вы не можете иметь ветку, которая существует только в одном файле, но стоит отметить, что у людей часто есть ветви, которые изменяют только один файл. Поскольку метаданные ветви хранятся в наборе изменений, а так как набор изменений содержит только дельту (изменение), наличие ветви, которая изменяет только один файл, почти мгновенно создает, обновляет, фиксирует и объединяет, плюс оно почти не занимает место на диске.
В результате это очень распространенный способ обработки конфигураций для каждого клиента. Храните крошечное изменение для них в ветке и переходите от основной, где происходила разработка, к этой ветке, всякий раз, когда вы хотите обновить их развертывание.