Если на самом деле зависит от уровня активности, который, как вы подозреваете, будет генерировать сайт - если это веб-сайт с высоким трафиком, у вас скоро кончатся соединения (если вы не установите для настройки максимальных подключений MySQLs тупо высокий уровень, но что в конечном итоге остановит сервер).
Как правило, я бы рекомендовал, чтобы интерфейс веб-сайта использовал объект общей базы данных (singleton is your friend
), поскольку для написания этого не требуется большой дисциплины, это разум, и вы не будете тратить время на установление связей. Если вам требуются дополнительные параллельные запросы к бэкэнду, это не должно быть слишком сложным делом, поскольку вряд ли это будет область с высокой посещаемостью.