Нет, тайм-ауты могут быть указаны только в конфигурации привязки, и конфигурация привязки присоединяется к конечной точке, поэтому все методы обслуживания в этой конечной точке получают одинаковые тайм-ауты.
Единственное, что вы можете сделать, это разделить вашу службу на два контракта и выставить два на двух отдельных конечных точках («FastEndpoint» против «SlowEndpoint»), а затем использовать разные настройки для каждой конечной точки для обработки этой ситуации.