Зависит от того, какую версию IIS вы используете, какое это приложение и что еще.
Но, в принципе, щелчок правой кнопкой мыши и команда публикации могут работать.
Некоторые службы веб-хостинга не позволяют удаленно получить доступ к их IIS, они обычно позволяют использовать FTP или что-то подобное для загрузки вашего сайта.
Если это так, опубликуйте на локальном компьютере и скопируйте и вставьте его на сервер оттуда.
Если вы используете базы данных, вам также следует создать необходимую базу данных на сервере.
Возможно, вам также придется немного подправить свою конфигурацию (файл Web.config) для различия между сервером и вашим локальным компьютером.