В поле «Найти и заменить» включите использование регулярных выражений.
Найти что:
ID="{[^\"]+}" runat="server"
Заменить на:
runat="server" ID="\1"
Используйте {}, чтобы пометить подвыражения в регулярном выражении. Значение части поиска: найти один или несколько символов, которые не являются кавычками после ID = "и до следующей кавычки, и пометить его как подвыражение.
В качестве замены вы используете \ 1 для обозначения первого найденного под-выражения, и это идентификатор тега.
Редактировать: добавить один пробел перед поиском и заменить выражения, чтобы избежать совпадения с чем-то вроде: ContentPlaceHolderID="MainContent" runat="server"
.