У меня была такая же проблема, и я решил ее;
Это произошло потому, что версия Java EE была выше, чем требуется для версии Tomcat.
Что делать:
Перейдите на вкладку files рядом с вкладкой проектов. В папке nbproject выберите j2ee.platform , если вы используете Tomcat7, чем, например, измените платформу на 1.6 (Tomcat6> Jave EE 1.5). чем сделать «очистить и построить» на проекте.
Теперь сервер перейдет в Project> properties> Run> Servers