Это не правда. Вы используете одно и то же хранилище ключей независимо от того, какие библиотеки SSL вы используете. Я использовал одно и то же хранилище ключей для нескольких экземпляров Tomcat. Некоторые из них используют APR.
Если вы знакомы с keytool, вы можете создать сертификат с помощью keytool, и он просто отлично работает с OpenSSL.