Нельзя отключить JavaScript в iFrames или любых других ресурсах AFAIK.
Единственный способ надежно сделать это - загрузить сайты через прокси-сервер PHP или другой серверный скрипт, отфильтровать любой JavaScript (который нарушит работу многих сайтов) и исправить все относительные ссылки на изображения и другие медиафайлы. задача, которая потребует безумного количества времени, если вы хотите, чтобы сайты действительно работали.
Если вам просто нужны данные с сайтов, прокси может работать. Поскольку единая политика происхождения не позволит вам получить что-либо от IFRAME из другого домена, это также единственный способ получить доступ к контенту на этих сайтах с помощью JavaScript.