У меня были проблемы с доступом к относительным ресурсам при загрузке файла по пути. Попробуйте загрузить файл в память в виде строки или данных, чтобы вы могли явно передать базовый URL.
NSURL *bundleURL = [NSURL fileURLWithPath:[[NSBundle mainBundle] resourcePath]];
тогда
[yourWebView loadHTMLString:yourHTML baseURL:bundleURL];
или
[yourWebView loadData:yourHTML MIMEType:@"text/html" textEncodingName:@"utf-8" baseURL:bundleURL];
Я использовал это для доступа к ресурсам изображений, но это также может помочь с относительными ссылками.