C #: как читать части файла? (DICOM)

Question

Я хотел бы прочитать файл DICOM в C #. Я не хочу делать что-то необычное, я просто хотел бы знать, как читать элементы, но сначала я бы хотел узнать , как читать заголовок, чтобы проверить, является ли файл DICOM действительным .

Он состоит из двоичных элементов данных. Первые 128 байтов не используются (установлены в ноль), за которыми следует строка «DICM». Затем следует информация заголовка, которая организована в группы.

Пример заголовка DICOM

First 128 bytes: unused DICOM format.
Followed by the characters 'D','I','C','M'
Followed by extra header information such as:

0002,0000, File Meta Elements Groups Len: 132
0002,0001, File Meta Info Version: 256
0002,0010, Transfer Syntax UID: 1.2.840.10008.1.2.1.
0008,0000, Identifying Group Length: 152
0008,0060, Modality: MR
0008,0070, Manufacturer: MRIcro

В приведенном выше примере заголовок организован в группы. Группа 0002 hex является группой метаинформации файла, которая содержит 3 элемента: один определяет длину группы, другой хранит версию файла, а их - синтаксис передачи.

Вопросы

• Как прочитать файл заголовка и проверить, является ли он файлом DICOM, проверив наличие символов «D», «I», «C», «M» после 128-байтовой преамбулы?
• Как мне продолжить анализ файла, считывая другие части данных?

Answer 1

Примерно так должно читаться файл, его основной и не обрабатывать все случаи, но это будет отправной точкой:

public void ReadFile(string filename)
{
    using (FileStream fs = File.OpenRead(filename))
    {
        fs.Seek(128, SeekOrigin.Begin);
        if ((fs.ReadByte() != (byte)'D' ||
             fs.ReadByte() != (byte)'I' ||
             fs.ReadByte() != (byte)'C' ||
             fs.ReadByte() != (byte)'M'))
        {
            Console.WriteLine("Not a DCM");
            return;
        }
        BinaryReader reader = new BinaryReader(fs);

        ushort g;
        ushort e;
        do
        {
            g = reader.ReadUInt16();
            e = reader.ReadUInt16();

            string vr = new string(reader.ReadChars(2));
            long length;
            if (vr.Equals("AE") || vr.Equals("AS") || vr.Equals("AT")
                || vr.Equals("CS") || vr.Equals("DA") || vr.Equals("DS")
                || vr.Equals("DT") || vr.Equals("FL") || vr.Equals("FD")
                || vr.Equals("IS") || vr.Equals("LO") || vr.Equals("PN")
                || vr.Equals("SH") || vr.Equals("SL") || vr.Equals("SS")
                || vr.Equals("ST") || vr.Equals("TM") || vr.Equals("UI")
                || vr.Equals("UL") || vr.Equals("US"))
               length = reader.ReadUInt16();
            else
            {
                // Read the reserved byte
                reader.ReadUInt16();
                length = reader.ReadUInt32();
            }

            byte[] val = reader.ReadBytes((int) length);

        } while (g == 2);

        fs.Close();
    }

    return ;
}

Код на самом деле не пытается принять во внимание, чтоСинтаксис передачи закодированных данных может измениться после элементов группы 2, он также не пытается ничего делать с фактическими значениями, считанными в.

Answer 2

Быстрый Поиск в Google вызвал три библиотеки DICOM C #:

• openDICOM.NET
• DICOM #
• mdcm

Answer 3

Просто немного псевдологии

Как прочитать файл заголовка и проверить, является ли он файлом DICOM, проверив наличие символов «D», «I», «C», «M» после 128-байтовой преамбулы?

• Открыть как бинарный файл, используя File.OpenRead
• Найдите позицию 128, прочитайте 4 байта в массив и сравните его значение байта [] для DICM. Вы можете использовать ASCIIEncoding.GetBytes () для этого

Как мне продолжить анализ файла, читая другие части данных?

• Продолжить чтение файла, используя Read или ReadByte, используя описатель объекта FileStream, который вы использовали ранее
• Используйте тот же метод, что и выше, для сравнения.

Не забудьте закрыть и утилизировать файл.

Answer 4

Вот пример в C #: http://www.codeproject.com/KB/graphics/dicomImageViewer.aspx

Answer 5

Взято из EvilDicom.Helper.DicomReader из библиотеки Evil Dicom :

 public static bool IsValidDicom(BinaryReader r)
    {
        try
        {
            //128 null bytes
            byte[] nullBytes = new byte[128];
            r.Read(nullBytes, 0, 128);
            foreach (byte b in nullBytes)
            {
                if (b != 0x00)
                {
                    //Not valid
                    Console.WriteLine("Missing 128 null bit preamble. Not a valid DICOM file!");
                    return false;
                }
            }
        }
        catch (Exception)
        {

            Console.WriteLine("Could not read 128 null bit preamble. Perhaps file is too short");
            return false;
        }

        try
        {
            //4 DICM characters
            char[] dicm = new char[4];
            r.Read(dicm, 0, 4);
            if (dicm[0] != 'D' || dicm[1] != 'I' || dicm[2] != 'C' || dicm[3] != 'M')
            {
                //Not valid
                Console.WriteLine("Missing characters D I C M in bits 128-131. Not a valid DICOM file!");
                return false;
            }
            return true;

        }
        catch (Exception)
        {

            Console.WriteLine("Could not read DICM letters in bits 128-131.");
            return false;
        }

    }

Answer 6

вы также можете использовать как это.

FileStream fs = File.OpenRead(path);

byte[] data = new byte[132];
fs.Read(data, 0, data.Length);

int b0 = data[0] & 255, b1 = data[1] & 255, b2 = data[2] & 255, b3 = data[3] & 255;

if (data[128] == 68 && data[129] == 73 && data[130] == 67 && data[131] == 77)
        {
           //dicom file
        }
        else if ((b0 == 8 || b0 == 2) && b1 == 0 && b3 == 0)
        {
            //dicom file
        }