Возможно, вы захотите написать Службу Windows .
Если вам просто нужно выполнить определенное действие в определенное время, вы можете использовать Windows Task Scheduler .
Если вам нужен значок на панели задач, вы можете написать обычное приложение Windows Forms, но основная форма будет скрыта, пока пользователь не запросит ее. Эта статья объясняет, как.