У меня была очень похожая проблема с eclipse (Juno) в Fedora 18. В середине отладки сеанса Android затмение завершило сеанс отладки. Я попытался перезапустить затмение, но оно продолжало работать на заставке. Я попробовал различные предложения выше, но безуспешно. Наконец, я проверил сервис adb (мост отладки Android):
# adb devices
List of devices attached
XXXXXX offline
Я знаю, что устройство Android все еще подключено, но оно сообщило об этом в автономном режиме. Я отключил устройство и выключил службу ADB:
# adb kill-server
Потом я подождал несколько секунд и перезапустил службу adb:
# adb start-server
И снова подключил мой андроид. После этого затмение запустилось просто отлично.