После того, как вы загрузили его в свой локальный репозиторий, вы можете сделать его копию. Дайте ему новый artifactId (например, libraryName-myVersion) и добавьте зависимости в pom. Убедитесь, что вы изменили имена папок, jar-имена, имена pom и сам artifactId в pom. Храните все в вашем локальном хранилище. Теперь вы можете использовать взломанную версию вашей зависимости.
Но, честно говоря, я не думаю, что это хорошая идея. Но, возможно, это помогает / не может быть предотвращено в вашем случае.