Большая часть моего кода jQuery подразделяется на две категории: плагины и материалы для загрузки на странице.
Для плагинов вот самый простой способ:
(function($) {
$.fn.myplugin = function() { ... };
})(jQuery);
Для загрузки на странице, которая составляет большую часть, просто сделайте это:
jQuery(function($) {
$('a[href$="foo"]').click( ... );
});
Таким образом, не имеет значения, включены ли дополнительные библиотеки (например, Prototype), и вы все равно можете использовать $ вместо того, чтобы каждый раз вводить "jQuery".