Если вы сохраняете настройки с помощью файла Settings.settings в папке Properties, вы можете просто сделать:
Properties.Settings s = new Properties.Settings();
И тогда все настройки будут свойствами s (вы даже можете определить их как определенный тип), и если они установлены как пользовательские настройки, вы можете изменить их.
Просто вызовите «Обновить» или «Сохранить» в экземпляре «Настройки» для чтения / сохранения с / на диск.