Это может быть.
Без схемы (например, xsd или dtd ) невозможно знать наверняка.
Некоторые парсеры / манипуляторы проверяют соответствие схеме, а иногда они настроены на использование внешней схемы, что означает, что ваша программа может (раньше, чем вы думаете) загрузить некоторые схемы и не выполнить ваши запросы на удаление или манипулировать документом так, как этого не позволяет схема.
Если вы не используете схему или (что еще хуже) используете специальный анализатор, который вы или кто-то из вашей компании написал), то я подозреваю, что в вашем анализаторе есть ошибка.