Построение нескольких сравнений?

Question

Когда кто-то хочет сравнить (протестировать) несколько групп (как, например, при выполнении anova), он сталкивается с проблемой множественных сравнений. То же самое относится, если мы хотим построить сравнение.

Мой вопрос, таким образом, какие инструменты (в R) вам известны, которые позволяют строить графики, отражающие множественные сравнения?

В настоящее время я знаю только два (хотя я уверен, что их больше):

1. TukeyHSD () в сочетании с сюжетом ()
2. Способ, которым boxplot выбирает «метки»

Answer 1

Пакет multcomp имеет, например, plot.cld() - вы можете попробовать

library(multcomp)
example(plot.cld)

Кроме того, быстрый поиск по «множественному сравнительному графику» на http://rseek.org позволяет обнаружить еще несколько пакетов и представлений задач.

Answer 2

Есть несколько методов для множественных сравнений в GLM

http://www.r -bloggers.com / многоразовое сравнения-в-glmms-используя-glmer-glht /

Статья об одновременном выводе из Справочника статистического анализа R-Project (веб-сайт) ...

http://cran.r -project.org / веб / пакеты / HSAUR2 / виньетки / Ch_simultaneous_inference.pdf

plotmeans () из пакета gplot. Это включает в себя доверительные интервалы.

Тогда есть функция error.bars.by () пакета «psych». Графики средних и SD группируются из кадра данных.

Некоторые используют графики плотности для визуализации.

# Compare MPG distributions for cars with 
# 4,6, or 8 cylinders
library(sm)
attach(mtcars)

# create value labels 
cyl.f <- factor(cyl, levels= c(4,6,8),
  labels = c("4 cylinder", "6 cylinder", "8 cylinder")) 

# plot densities 
sm.density.compare(mpg, cyl, xlab="Miles Per Gallon")
title(main="MPG Distribution by Car Cylinders")

# add legend via mouse click
colfill<-c(2:(2+length(levels(cyl.f)))) 
legend(locator(1), levels(cyl.f), fill=colfill)