Конечно, ничего страшного в этом нет. Первое, что я сделал, когда мне надоело копать installutil и / или gacutil. Вам нужно только добавить:
%WINDIR%\Microsoft.NET\Framework\v2.0.50727
или
%WINDIR%\Microsoft.NET\Framework64\v2.0.50727
... в зависимости от того, хотите ли вы 64-битные утилиты или нет. Обычно вам не нужно добавлять каталоги 3.0 или 3.5, и они на самом деле просто надстройки для 2.0. *