Я только что нашел способ сделать это, используя расширение eclipse:
<plugin>
<extension
point="org.eclipse.ui.workbench.texteditor.hyperlinkDetectors">
<hyperlinkDetector
activate="true"
class="testproject.ShouldAnnotationDetector"
id="testProject.shouldAnnotationDetector"
name="name"
targetId="org.eclipse.jdt.ui.javaCode">
</hyperlinkDetector>
</extension>
</plugin>
где testproject.ShouldAnnotationDetector должен расширять testproject.ShouldAnnotationDetector