2 Основные шаги должны произойти:
- MySQL должен быть установлен на клиенте
- Ваша база данных должна быть создана.
Для шага 2 я рекомендую создать скрипт вашей базы данных в начальном состоянии, или же ваши клиенты ожидают, что база данных будет, когда они начнут использовать ваше приложение.
Возможно, вы сможете использовать мастер публикации базы данных SQL в Visual Studio для автоматического создания сценария, который создаст вашу базу данных.
http://blogs.msdn.com/b/webdevtools/archive/2007/10/15/sql-database-publishing-wizard-is-now-in-visual-studio-orcas.aspx
Вы можете поручить своему клиенту запускать скрипт .sql, или вы можете вызвать mysql из командной строки, чтобы запустить скрипт как часть установщика.
Я проделал аналогичную процедуру с приложениями SQL Server, поэтому я ожидал, что это должно работать аналогично