Оказывается, это очень просто с консоли 389 (пользовательский интерфейс для сервера каталогов 389).
На вкладке «Задачи» в пользовательском интерфейсе сервера каталогов нажмите ссылку «Экспорт баз данных».
При этом будет экспортирована схема LDAP как и файл LDIF (формат обмена данными LDAP), который является стандартным форматом для информации LDAP.