Предполагая, что вы входите в файл, у всех файловых приложений log4j есть свойство append
, которое можно установить в false, чтобы всегда начинать заново, или в true, чтобы добавлять в предыдущие журналы. например:
appenders {
rollingFile name: 'file', file: 'mySite.log', append: false
}