NHibernate не имеет встроенного инструмента миграции. Он может генерировать всю базу данных, вы не можете выбрать части из него. Лучшее, что вы можете сделать с NHibernate - это создать дамп sql-журнала генерации базы данных и скопировать и вставить новые детали в сценарий sql.