Зависит от вашей аудитории и контента.min-height поддерживается не всеми браузерами, но есть способы обойти это.
Суть в том, что вам нужно, чтобы ваш сайт работал для вашего контента, а не наоборот.Если на некоторых страницах не очень много контента, вам следует подумать о консолидации страниц или придумать более креативные способы отображения контента.
Чтобы прямо ответить на ваш вопрос, липкий нижний колонтитул излишне занимает ценное пространство экрана,Если в вашем нижнем колонтитуле нет важного контента, я бы применил минимальную высоту вашего # main-content.