Если вы имеете в виду, что вы хотите запустить Eclipse с некоторыми аргументами командной строки, то нет файла, куда вы могли бы добавить те, которые будут использоваться по умолчанию. Но вы можете сделать небольшой скрипт, который запустит Eclipse с нужными вам аргументами, например:
/Applications/Eclipse.app/Context/MacOS/eclipse some command line arguments
и затем добавьте исполняемые права доступа к вашему сценарию через окно терминала:
chmod 755 your_file
Вы можете просто набрать "chmod 755
" на терминале, а затем перетащить файл скрипта в окно терминала, он наберет полный путь к файлу, нажмите ENTER и все. Вы можете дважды щелкнуть файл скрипта, и он запустит Eclipse с набранными аргументами командной строки.