При условии, что данные не слишком велики (в смысле фактических значений), вы можете просто добавить их в качестве параметра в URL (например, Popup.aspx?Data1=Piece_of_data&Data2=Piece_of_data
).
В противном случае вы, вероятно, захотите сделать то же самое с запросом POST, это зависит от того, как именно вы открываете всплывающее окно;)