Обычно вы выбираете один или другой тестовый фреймворк, а не работаете с двумя. Хотя на самом деле, как отмечает Сергей, фреймворки NUnit и MSTest достаточно похожи, так что вы можете с осторожностью написать общие тесты, которые могут работать с обеими фреймворками. Однако есть некоторые тонкие различия, поэтому следите и придерживайтесь наименьшего общего знаменателя!
Если вы хотите запустить набор тестов, написанных для нескольких платформ, взгляните на Gallio , который поддерживает этот сценарий.